本发明公开了TmDGAT1b基因的启动子及其应用，属于生物技术领域。所述启动子为如下任一所示：1）核苷酸序列为序列表中SEQ ID No.1的DNA；2）核苷酸序列与SEQ ID No.1互补的DNA；3）在高严紧条件下能够与上述1）或2）DNA杂交且具有启动子功能的DNA；4）对上述1）或2）所示DNA进行一个或多个碱基的取代、缺失和/或添加且具有启动子功能的DNA；5）与上述1）或2）所示DNA具有至少90％同源性且具有启动子功能的DNA。本发明的启动子能特异调控外源基因表达，能使外源基因在拟南芥茎组织中得到表达，具有重要应用价值。